幽門螺桿菌三聯療法一般是一種PPI加兩種抗生素，目前臨床上使用較少，因為很容易出現耐藥。目前臨床上更多使用的是幽門螺桿菌四聯療法，即PPI加兩種抗生素，再加鉍劑，加用鉍劑的目的是增加抗幽門螺桿菌的有效率。幽門螺桿菌，臨床上現在最常用的抗生素一般是阿莫西林，再加呋喃唑酮。也可以通過胃鏡下取胃竇組織，做幽門螺桿菌培養加藥敏，根據藥敏結果選擇敏感抗生素，這樣可能治療的有效率會更高。而且幽門螺桿菌感染以后，有幾類人群必須抗幽門螺桿菌治療，比如有幽門螺桿菌感染的慢性胃炎、消化性潰瘍病人，還有胃有MALT淋巴瘤、特發性血小板減少性紫癜的病人。證實有幽門螺桿菌感染的時候，要進行抗感染治療，比如病人做檢查，發現有幽門螺桿菌感染癥狀，或者有治療意愿的病人，都建議進行幽門螺桿菌治療。