肺真菌病跟肺結核鑒別主要是針對浸潤型肺結核進行鑒別，主要有以下幾點： 1、肺真菌病發生人群主要是慢性消耗性、免疫力低下或長期使用免疫抑制劑的患者；而肺結核也可出現在這類人群身上，但是肺結核患者有結核病患者的接觸史，這是不同的。 2、肺真菌病患者起病比較急，病情比較重；肺結核是一個慢性疾病，會出現結核中毒的癥狀，如發熱、咳嗽、咳痰、咳血； 3、影像學變化，肺真菌病患者胸片主要表現為中下肺葉病變，也可出現菌球，易與結核病的空洞鑒別；肺結核患者胸片病變范圍主要出現在雙肺尖后段、下葉背段； 4、肺真菌病試驗室檢查可能會找到真菌，如白色念珠菌一類；而肺結核試驗室檢查主要在涂片上找到結核菌，抗酸染色是陽性的，痰結核菌培養也是陽性的； 5、治療方面，肺真菌病主要是抗真菌治療；肺結核治療主要是抗癆、抗結核治療。這是兩者的主要區別。