我們把對人體有益的細菌叫做益生菌，益生菌對治療兒童急性感染性腹瀉具有療效，尤其是對病毒感染導致的水樣腹瀉具有顯著的療效，早期用效果是比較好的。常用的益生菌制劑有復方嗜酸乳桿菌、酪酸梭菌活菌散、布拉氏酵母菌散等。這里需要注意的是，益生菌治療兒童急性感染腹瀉病的療效與菌株和劑量相關，即益生菌具體需要區分不同菌株，并不是每種菌株對腹瀉都有效，服用劑量不足也不能達到止瀉作用。更需要注意的是，這類藥物大多數需要放置冰箱保鮮，服用時水溫不能過高。另外，如果聯合使用抗菌藥物，應該先服用抗菌藥物，待腸道抗菌藥物吸收差不多后再服用益生菌制劑。