建議兒童餐后0.5-1個小時服用益生菌，盡量減少胃酸和膽汁對益生菌影響，從而達到最佳效果。家長還需注意給兒童服用益生菌時不可用開水沖泡或使用溫度過高的水，否則會導致益生菌活性降低或殺滅。此外，需注意避免將益生菌與抗生素一并服用，若兒童病情需要抗生素治療，則建議服用二者間隔2個小時。益生菌屬于人體腸道桿菌，兒童出生前腸道處于無菌狀態，而出生后24小時左右腸道內便會充滿細菌，在不到1個月時間內兒童腸道菌群總量和數量已基本接近于成人。益生菌最早用于治療腹瀉，隨后研究發現具有雙向調節作用，可用于腹瀉和便秘，益生菌具有調節腸道菌群作用。而近年更多研究表明，益生菌除調理腸道外，對部分免疫及過敏反應也有一定益處和治療作用，因此應用范圍逐漸擴大。兒童服用益生菌時可參考上述注意事項，以達到最佳效果。