因生理結構和解剖結構的不同，男女性非淋的臨床表現不同。男性非淋患者常表現為小便時疼痛，小便的次數增加，尿道有刺癢，或感覺不舒服；尿道分泌物增多，呈現為漿液性或漿液膿性，甚至帶有血性；有時還可感覺到陰莖有局部疼痛，部分患者可引起附睪炎、睪丸炎，陰囊上出現腫脹、發紅，有觸痛。女性患者常表現為尿道分泌物的增多，呈漿液性或漿液膿性，可以伴有尿痛，小便次數的增加，白帶增多，顏色發黃或帶有血性，甚至伴有異味；部分女性在非月經期或性交后引起出血，檢查時宮頸口有較多的膿性分泌物，宮頸有充血、水腫、脆性的增加，觸碰易出血。