卵巢囊腫部分會引起不孕癥狀。月經后期，因為排卵異常導致的生理性卵巢囊腫，不會影響受孕。但是，部分卵巢囊腫會導致月經失調，或者惡性的囊腫，都會導致不孕癥狀。子宮內膜異位癥也會引起卵巢囊腫，不但對卵巢功能有損傷，也會引起排卵異常，影響受孕；另外，卵巢囊腫跟子宮盆腔炎癥有關系，囊腫扭轉影響卵子排出、影響卵子成熟，都會影響受孕。