錯頜畸形的病因主要有以下幾種： 1、遺傳因素：遺傳因素有兩個方面，一個是種族演化，另一個是雙親遺傳。種族的演化在人類進化過程當中，一個是行走的體位，我們的祖先猿人是在地上爬，然后慢慢進化，站立起來，還有食物發生變化，原始社會吃生的、粗糙的東西，慢慢進化為吃熟食，食物越來越精細，咀嚼功能逐漸減弱，口頜的器官也逐漸退化。在口頜器官中，頜骨的退化比牙齒快，牙齒相對于骨頭就顯得大了，不能很整齊的排列在頜骨里面，出現牙齒擁擠錯頜。雙親遺傳方面是父母親的臉型和牙齒的排列，都可能遺傳給子女； 2、獲得性的因素：胎兒時期，母親患一些疾病，如發高燒、接受放射量過大或外傷等，都可導致胎兒先天性牙頜面畸形。有表現為唇腭裂，還有牙齒的畸形。部分患者兒童時期發生佝僂病、慢性鼻炎、扁桃體炎等疾病都可能影響牙頜面的發育，引起牙頜畸形。兒童的食物很細軟，咀嚼器官得不到足夠的刺激，人工哺乳時奶瓶的位置和喂養姿勢不正確也可能受影響。一些不良習慣，如喜歡吐舌頭、咬筆、咬被子等也可引起牙頜畸形。此外換牙時不順利、有乳牙滯留、牙齒齲壞嚴重或先天性缺失牙等都可能引起錯頜畸形。 與遺傳因素有關的牙頜畸形約占30%，這種矯治有一定的困難，后天因素引起的畸形可以防治。