病態竇房結綜合征的治療原則，總的原則是根據病因治療。因為這個疾病主要問題出現在竇房結的功能障礙，功能障礙有很多原因，有的人常見的是心肌供血不足缺血導致，有的人是因為結締組織病引起的慢性的竇房結的病變。如果病人有病態竇房結綜合征，但是，他沒有相應的臨床癥狀，如頭昏、黑蒙、心慌、胸痛，甚至是暈厥，可以暫時不給予處理，可以積極的觀察；對于有癥狀的患者，可以臨時用藥物，但是這些藥物也是臨時的，不能長期使用，如異丙腎上腺素、阿托品類的藥物可以提高心率，但是，只是暫時性的，最終還是可能要選取心臟永久起搏器的植入術治療。