反流性食管炎的癥狀跟食管炎的程度并沒有相關性。有些反流性食管炎的病人，可以有非常典型的反流癥狀，有些病人甚至沒有任何的臨床癥狀，非常嚴重的食管炎病人的臨床癥狀并不一定很嚴重。反流性食管炎典型的臨床癥狀就是胸骨后燒灼感，也叫燒心，還有反流以及胸痛。燒心主要是胸骨后向頸部放射的燒灼感；反流就是胃內容物反流到咽部或者口腔。反流的癥狀通常在飽餐以后出現，如果夜間反流特別嚴重會影響到睡眠。到了晚期，反流性食管炎的燒灼感以及反酸癥狀可能會減輕，隨之而來出現的就是吞咽困難而造成疼痛。有一些比較嚴重的反流性食管炎病人，甚至會出現慢性出血，進而導致缺鐵性貧血。