腸鏡麻醉基本上無害。腸鏡檢查是內鏡醫師通過將腸鏡放入肛門，直至進入腸道，對腸道的整體情況進行診斷和治療的一種檢查方式。 由于將異物送入腸道內，因此對腸道黏膜必然會有一定的刺激作用，可引起患者不適感。為降低患者的傷害性刺激，腸道檢查時需應用麻醉藥物。麻醉藥物的應用通常需根據患者的年齡、體重，以及其他具體情況決定。 個別患者檢查后，通常有頭暈、惡心、嘔吐等情況。只要按照麻醉醫生的囑托，進行適當休息，延緩進食時間，則這種麻醉方式通常安全。