腸鏡麻醉大多數是非常短暫的過程，而且程度比較輕。因此，如果對于正常人，麻醉對身體的影響，幾乎可以忽略不計。如果有比較嚴重的基礎病變，還是有一定影響的。所以腸鏡麻醉對身體有沒有害，主要是看身體狀況。麻醉主要是非常基礎的麻醉，用一些鎮靜劑，比如舒芬太尼、丙泊酚這樣的藥物。當腸鏡結束時，基本上病人的鎮靜麻醉過程，也結束了，病人處于清醒的狀態。曾經有美國的研究，對于嬰幼兒的觀察，發現麻醉對嬰幼兒的身體，也幾乎不會帶來一些影響。但是如果要是基礎臟器功能比較差，比如有的人，有慢阻肺、肺功能非常差、肺氣腫等情況，血氧濃度比較低，對麻醉比較敏感。盡管麻醉程度很輕，對呼吸、對心臟，還是有一定抑制的。如果本身呼吸功能非常差，麻醉加重這種抑制，可能會出現血氧飽和度低，不容易清醒，甚至會出現低氧。如果心功能比較差，在很輕微的麻醉狀態下，也會對心功能產生進一步抑制，可能也會出現潛在的風險。