寶寶指甲凹陷的原因具體如下：1、外傷：外傷會造成指甲損傷，導致凹陷，隨著寶寶指甲長出以后，凹陷也會得到緩解；2、指甲本身疾病：有些寶寶出現真菌感染，或者是指甲的炎癥狀態，都可能造成指甲發育異常，出現凹陷的情況；3、營養性疾病：缺鐵、缺鋅，或者維生素、蛋白質等營養元素缺乏，均可能導致寶寶指甲發育異常，出現凹陷的情況。通常適當補充維生素、鋅、鐵等，改善營養狀態，指甲凹陷的情況也會得到緩解；4、缺氧性疾病：有些寶寶有心臟疾病，如先天性的缺氧性心臟疾病，都可能造成寶寶局部末梢循環不好，造成寶寶出現指甲發育異常，出現手指凹陷的情況。因此，寶寶如果出現指甲凹陷，在病因不清的情況下，可以到醫院進行相關的檢查，明確它產生的病因，針對性地進行治療之后，指甲凹陷情況才能得到有效緩解。