抗酸桿菌陰性指不支持結核桿菌的感染，因為如果在檢測的標本中存在結核桿菌，做抗酸染色時會發現陽性的結果，這是最可能的一種解釋。不過臨床在解讀檢測結果時，還需要結合臨床綜合的資料，才能做出最后的判斷。因為在臨床上情況更復雜，比如有可能病人是結核，但痰液或者標本里結核菌不多，沒有取到，抗酸桿菌染色就是陰性。總之，抗酸桿菌結果陰性不能完全排除結核的感染。另外如果病人臨床上都不支持結核，但是檢測出來陽性的結果，也有可能是其它抗酸陽性細菌感染所導致，比如假陽性或者水的污染。臨床遇到的任何檢測結果，都要結合臨床特征進行具體的分析。