乙肝病毒復制活躍的指標是乙肝病毒DNA，又稱為HBV-DNA。HBV-DNA越高，代表乙肝病毒復制越活躍，也標志著傳染性越強。對于慢性乙肝或肝硬化的患者，要定期檢測HBV-DNA，如果指標升高，就要評估是否要啟動抗病毒治療。慢性乙肝患者抗病毒治療的過程中，也要定期化驗，檢測HBV-DNA，由此判斷抗病毒的療效。通常啟動抗病毒治療，在應用抗病毒藥物3-6個月后，患者的HBV-DNA降到最低檢測值以下，說明抗病毒治療有效。最低檢測值需要應用高靈敏試劑進行檢測，檢測結果應在15IU/ml或20IU/ml以下。如果抗病毒治療啟動3-6個月，HBV-DNA仍然能用高靈敏辦法檢測到，說明抗病毒治療的方案效果不是特別理想，需要重新調整。