正常情況下，人體的甲胎蛋白維持在一個較低的水平，即<25μg/L。通常甲胎蛋白超過25μg/L，提示可能存在癌癥疾病，如原發性肝癌或者胚胎性的腫瘤等，急性活動期的乙型肝炎病人或者肝硬化的患者等，有時也會出現甲胎蛋白明顯升高。因此，臨床上，當出現甲胎蛋白異常時，應該完善超聲、核磁共振、CT等多項檢查，來明確導致甲胎蛋白升高的確切原因。還要進一步檢查乙肝六項、乙肝病毒復制等情況，從而才能及時地降低甲胎蛋白的水平。對于不同的病因，如癌癥病變，通過手術、放化療等治療手段，使癌癥得到有效控制，從而使甲胎蛋白恢復正常。對于某些非癌癥的良性病變，也可以通過及時有效的藥物治療來控制疾病發展，從而使甲胎蛋白恢復正常。