部分睪丸腫瘤患者的甲胎蛋白會有所升高，升高數值因病人、病情而異，并不是所有的睪丸腫瘤患者甲胎蛋白都會升高。常見的睪丸腫瘤分為幾種亞型，如精原細胞瘤，甲胎蛋白不會升高，另外非精原細胞瘤里的胚胎癌，多數患者會有甲胎蛋白升高。甲胎蛋白升高，可作為睪丸腫瘤的瘤標之一進行病情判斷，以幫助早期發現睪丸腫瘤的存在，還可以依靠甲胎蛋白數量的高低進行腫瘤分期。另外術后可通過監測甲胎蛋白，來監測腫瘤復發或轉移。如果術前甲胎蛋白升高，做完睪丸根治性切除手術后，甲胎蛋白回落到正常值內。經過一段時間隨訪，發現甲胎蛋白再次升高，多數提示腫瘤復發和轉移的可能。