反頜牙的治療分為幾個時期。乳牙期改變牙位與移動下頜的效果比其他時期理想，簡單的活動矯治器都可達到目的，功能性矯治器效果良好，矯治時間在3-5歲。替牙期反頜的矯治復雜多變，是前牙反頜矯治的關鍵時期。無論哪種類型反頜，首先要通過上下前牙的移動，解除前牙反頜關系，以利于上下頜骨的生長趨向正常。替牙期反頜的矯治涉及到各種矯治器，包括可摘矯治器、頜墊式矯治器、功能矯治器 FrankelⅢ 、固定矯治器和口外矯治器，如前方牽引裝置等。恒牙期反頜的矯治由于恒牙期反頜已經發育成熟，骨代謝很慢，很難通過改變生長來調整頜骨關系，所以恒牙早期多需要拔牙等掩飾性治療解除反頜以達到面型改善。更為嚴重的骨性反頜，則需要等患者年滿18周歲再進行外科正頜手術，通過手術修復畸形的頜骨。