腦部核磁共振其實是神經科常用的影像學檢查方法，它是比較清楚的影像學檢查方法，比頭顱CT顯示的要清楚。它分不同的像，有T1像、T2像、FLAIR像，還有彌散像和磁敏感成像。不同的像有不同的作用，主要是可以觀察腦部的正常結構和病變。對于常說的急性腦血管病，尤其是缺血性腦血管病、腦梗死，磁共振比較敏感，尤其是結合彌散成像，可以在短期時間內顯示腦梗死的缺血病灶。有研究顯示，在90分鐘之內就可以顯示缺血性病灶，比CT顯示的要早，而且顯示的要清楚。此外，它對一些其它的腦部病變，像腦萎縮、腦腫瘤、腦出血、腦炎都有較好的顯示。此外，腦部磁共振還可以進行血管的檢查，叫MRA，它可以顯示顱腦的血管有沒有狹窄，有沒有動脈瘤。總之，頭顱的磁共振是比較好的檢查方法。