肛周膿腫的臨床表現根據其位置高低不同則有不一樣。常見低位的肛周膿腫，最主要表現是肛門周圍紅、腫、熱、痛，有的人是搏動性疼痛，瘀膿，然后肛周包塊有的時候成膿以后會比較軟，個別的時候如果離皮比較近會透皮而出，膿流出來的時候疼痛緩解一些。但是低位膿腫還有如果發生在男性，可能會引起小便困難。另外，膿腫根據范圍，比較大的膿腫會引起發熱。如果膿腫位置比較高，解剖結構比如骨盆直腸窩膿腫，這個膿腫比較特殊，它并不是以局部表現為主，會全身高熱以及寒戰，但是局部只有墜脹感、墜痛感。這種感覺往往考慮會不會有局部肛門高位膿腫，這個膿腫不會自行破潰，有時候拖得比較久會破潰成腸瘺，這是比較復雜的情況。所以如果發現肛門周圍腫起包來，然后紅、腫、熱、痛比較劇烈，建議盡早就醫，肛門周圍臀部脂肪組織比較多，局限感染能力比較差，很容易竄的位置很大、很高。其實化膿的位置在日后做完手術以后，膿腔很深，長起來會很慢，所以這屬于肛腸科急癥，越早進行處理手術治療或者排膿處理，日后恢復起來越快。