治療霉菌性龜頭炎的特效藥一般是抗真菌或抗霉菌的藥物，常用的有口服和外用兩種劑型，常用藥品如下：1、口服藥：氟康唑、伊曲康唑以及兩性霉素等都是應用于霉菌或真菌治療最常用和有效的藥物；2、局部用藥：軟膏類的藥物，如克霉唑軟膏或咪康唑軟膏等涂抹在包皮、龜頭上可以有效抑制局部的霉菌生長。如果使用藥膏不方便或有刺激性，可以使用殼聚糖噴劑或者幾丁糖噴劑等，對于霉菌、真菌或細菌同樣有一定的治療作用，還能促進表皮的愈合。一般清晨或者睡前還應該配合清洗，可以選擇稀釋的碘伏溶液、聚維酮碘、皮膚康洗液、洗必泰溶液、硼酸洗劑，稀釋后的高錳酸鉀溶液等藥物，都對皮膚黏膜刺激性較小。