肛周囊腫可能來自于肛周的皮脂腺囊腫或肛周膿腫等，皮脂腺囊腫與毛囊和粉刺有密切的關系，一般是皮脂腺在毛囊內的聚集形成的局部囊腫。對于囊腫，一般如果沒有明顯的感染，可以不予處理，治療囊腫可以用手術的方式將其切除。肛周膿腫如果僅發生于表淺的軟組織，在出現波動后可以及時切開引流，控制感染。如果肛周膿腫與肛瘺相關，囊腫大多遷延不愈、反復發作。一旦出現膿腫，要注意探查是否和肛瘺疾病相關。如果是肛瘺，要將瘺管完整切開，使新生的肉芽組織由內向外的生長，隨著肛瘺的愈合，肛周膿腫會徹底痊愈。出現肛周疾病的時候，一定要注意控制飲食，如痔瘡、肛裂、肛瘺等，要保持大便通暢，并減少刺激性食物的攝入。對于緩解肛周疾病，減輕肛周疾病的癥狀尤其重要。