肛周最常見的囊腫包括表皮樣囊腫、皮樣囊腫，或者良性的畸胎瘤，這種情況下往往會出現壓迫癥狀。囊腫在比較小的時候沒有明顯的臨床表現，隨著囊腫長大會壓迫周圍的組織，如囊腫壓迫直腸，患者會出現排便困難或排便次數減少，或出現腹脹。如果壓迫前列腺，也可以出現排尿的癥狀。如果囊腫向外突出生長，會在肛門周圍出現腫塊，一般沒有明顯壓痛，但如果伴有感染，也可出現疼痛，所以囊腫主要是壓迫癥狀。如果擠壓輸尿管，囊腫比較大，也可以出現腎積水或腰痛。所以囊腫一般是良性疾病，但也不排除部分囊腫可能出現惡變，如皮樣囊腫或畸胎瘤。隨著囊腫、畸胎瘤長大，也可以出現惡變，出現惡變后，腫瘤可侵犯神經，出現下肢或周圍疼痛癥狀。