甲狀腺囊腫的手術并不是特別痛苦，因為在進行甲狀腺囊腫手術的時候，無論如何都會給患者進行適當的麻醉。有的醫生愿意給患者局部麻醉；有的醫生為了減少患者在術中的恐懼和不適感，會讓麻醉師給予患者全身麻醉，使患者有更好的手術體驗。但是無論何種手術方式，手術切除的部位和范圍沒有太大差別，因此患者不必對甲狀腺囊腫手術有太多的恐懼感。而且甲狀腺囊腫本身是屬于良性病變，只要進行了局部切除，或者連同囊腫周圍的部分甲狀腺部分切除，疾病便可以達到治愈的目的。當然甲狀腺囊腫切除以后。由于會有甲狀腺的殘留，在剩余的甲狀腺組織中，以后仍然會有甲狀腺囊腫再次復發的可能。因此對于甲狀腺囊腫的手術適應證主要是患者的囊腫較大，產生了一定的壓迫癥狀，或產生了對患者外觀的影響，還需要進行手術切除。