甲狀腺囊腫，小的囊腫不需要摘除，比較大的需要手術摘除，手術摘除甲狀腺囊腫對甲狀腺功能的影響并不是很大，甲狀腺囊腫手術以后的副作用主要取決于囊腫大小和位置。如果囊腫比較小，原則上來講不需要手術處理。如果囊腫比較大或者比較靠后，甚至和周圍有某種程度的粘連，手術還是有一定的副作用的，有可能損傷喉返神經導致聲音嘶啞，也有可能損傷甲狀旁腺導致甲狀旁腺功能損傷等。甲狀旁腺囊腫是良性病變，也可以導致手術以后出血，甚至導致呼吸困難等。甲狀腺囊腫是囊性改變，非腫瘤性的，手術也不是絕對安全的。