患牙進行根管治療兩年后又發炎要尋找發炎的原因，針對不同的原因制定不同的治療方案。如果患者因為咬硬東西牙根折裂，需要對患牙進行拔除。患牙發炎的原因還有可能是遺漏根管，需要重新把患牙打開進行根管尋找，在顯微鏡的幫助下可能會很容易的找到遺漏的根管口，對原來充填材料取出、清理、消炎，常規的根管治療之后，一般患牙的炎癥能夠得到控制。