絕大部分孩子，急性腸胃炎自然病程在2周內，即多數孩子在1-2周后，癥狀會有所好轉。但部分孩子的腸胃炎較特殊，或繼發有其它并發癥，疾病恢復的時間可能就較長，有些孩子會延續好幾周，甚至好幾個月。小孩急性腸胃炎常由感染引起，如病毒或細菌感染等。一般病毒感染的自然病程在1周左右，相關癥狀如嘔吐、發熱、腹瀉等，多數情況下，尤其是腹瀉，一般不會超過2周，這是急性病程的特點。如果孩子是細菌感染，這時經積極地抗感染治療，孩子恢復的時間可能不會太長，部分3-5天就有明顯好轉，相關癥狀也可能持續在2周以內。所以大部分小兒急性腸胃炎的自然病程或正常恢復時間在2周內，但部分孩子較特殊，如部分孩子急性腸胃炎后繼發乳糖不耐受，這時孩子腹瀉的時間較長，持續時間就不能估計，部分需幾周痊愈，部分可能需幾個月，取決于能否判斷孩子的病情，以及能否做相應、及時對因和對癥處理。