核磁共振目前不常用于肺部檢查，主要是因為肺里面含有大量空氣，空氣對磁共振磁場非常敏感，會造成很大的偽影。偽影偏重以后對肺部的解剖結構、肺內病灶細節顯示不是非常清楚，所以目前用于肺部疾病檢查最常用肺CT。 現在有一些專家主要用核磁共振來對肺部進行研究、科研，特別是肺腫瘤研究，用磁共振觀察患者治療的效果、病灶大小有沒有改變，還有腫瘤治療以后信號有沒有改變。部分專家也在利用磁共振肺部成像與CT成像的圖像相應的病灶進行對比，但還是停留在科研的階段，不是普及階段，所以肺部的病變主要還是通過CT檢查，磁共振只能是做科研應用。