超聲內鏡是一種將超聲與內鏡檢查相結合的診斷方法，是在內鏡的前端集合上超聲的探頭，通過內鏡將微小的超聲探頭置入人體內。因此可以通過超聲內鏡來檢查胃腸道黏膜層以下的結構，比如肌層，甚至是漿膜層，以及胃腸道腔以外的周圍組織和器官的疾病。由于超聲內鏡與經腹的超聲探頭檢查的路徑不同，因此可以較好地避開胃腸道的氣體干擾，又由于超聲內鏡探頭的頻率比較高，能夠顯示病灶更加清晰。同時在超聲內鏡顯示的基礎上，還可以來引導進行細針穿刺細胞學的檢查，比如對于胰腺或腹膜后的部位，經腹的超聲引導穿刺活檢的風險會比較高，而在超聲內鏡引導下可以將比較細的針經過胃壁穿入到后方，比如胰腺或腹膜后的病灶中，進行組織細胞學的檢查，是較為有效的診斷方式。