超聲內鏡檢查的禁忌癥與胃鏡相似，具體如下： 1、嚴重心肺疾患無法耐受內鏡檢查的患者； 2、上消道大出血，處于休克等危重狀態者； 3、懷疑消化道穿孔患者； 4、精神病患者或者嚴重智力障礙，而不能配合內鏡檢查者； 5、腐蝕性食管炎、胃炎的急性期患者； 6、明顯的胸腹主動脈瘤患者； 7、腦卒中急性期患者； 8、高血壓患者血壓未得到有效的控制； 9、凝血機制障礙及出血傾向患者； 10、高度脊柱畸形。 對于此類患者，是不能進行超聲內鏡的檢查。