患者可在內鏡檢查同時進行超聲檢查，即腔內超聲或超聲內鏡。臨床中常見的B超屬于體表超聲，醫生通過體表超聲觀察患者肝臟、膽囊、胰腺、腎臟等臟器的疾病，但是對于臟器位置較深的器官觀察并不清晰。如胃部病變通過體表超聲B超無法清晰觀察，所以需要進行超聲內鏡檢查，它可以判斷胃部黏膜病變程度，同時可以確定病變的起源，有無浸潤及遠處淋巴結轉移。