肝膽外科和肝膽內科主要區別是診治的疾病不同，采用的治療方法也存在較大的區別。肝膽外科主要是通過外科手術治療肝膽系統疾病，肝膽內科主要是通過藥物干預對疾病進行診斷和治療。肝膽系統疾病種類較多，肝臟疾病包括肝臟炎癥性疾病、脂肪肝、藥物性肝損傷、自身免疫性肝病等。肝臟疾病也會發展成為肝硬化，合并門靜脈高壓癥和消化道出血，或是發生各種良性或惡性的腫瘤性疾病等。對于不同的肝臟疾病，治療方法有較大的區別，醫生所擅長的治療方法也存在較大的區別。肝膽外科醫生主要通過外科手術進行治療，包括腫瘤性疾病、內科性疾病合并外科并發癥，比如消化道出血、膽道結石和息肉等。肝膽內科醫生主要是判斷引起肝損傷的原因，以及如何通過藥物有效保護肝臟的功能、促進肝臟的再生、降低從慢性肝病發展成為嚴重肝病的風險。