肝膽管結石具體引起的原因，主要是膽汁中的成分比例失調，從而引起相應的物質析出結晶，形成結石的核心并逐漸地增大演變成結石，可以分為膽固醇性結石、膽色素性結石以及混合性結石。1、膽固醇性結石：主要是膽汁中的膽固醇與膽汁酸比例失調、膽固醇含量過高，這種情況下會析出結晶，從而逐步形成膽固醇性的結石，常與飲食因素有關。如長期的高脂肪、高膽固醇的飲食、肥胖、高血脂、糖尿病等，也包括一些膽汁淤積因素，從而形成膽固醇性的結石，以膽囊結石較為多見；2、膽色素性結石：主要因為膽汁中的膽紅素含量過高，形成膽紅素鈣的飽和并形成相應的結石核心，從而導致結石的生成，常與膽道感染、膽汁淤積、膽道梗阻相關。這種情況下常見膽道感染后的炎癥或者膽汁淤積、膽道蛔蟲、膽道狹窄等原因導致的結石，針對這些結石需要根據具體的情況具體分析，如果出現相應的急性癥狀，需要緊急地給予消炎、對癥的處理。此外這些結石也是引起膽管炎、膽囊炎反復發作的重要誘因，要針對這些結石進行根治性的治療，才能有效地控制膽道感染的發生，避免形成惡性循環。即膽道感染導致膽汁淤積、膽道結石，而膽道結石又加重膽道感染，所以最終需要靠手術來打破循環，達到根治的效果。