肝膽外科主要治療以下幾方面疾病：1、肝臟：肝臟的各種惡性腫瘤，如果能做手術，比如肝癌、轉移性肝癌，都需要外科手術。肝臟良性腫瘤，比如較大的肝囊腫，非常大的肝血管瘤或者肝腺瘤，診斷不清楚的肝臟大占位病灶，需要做手術明確或者手術處理；2、膽囊：如膽囊良性疾病，膽囊腺肌癥、膽囊結石，比較嚴重的膽囊炎需要切除膽囊，還可以治療膽囊腫瘤；3、膽管：包括膽管腫瘤，膽管癌分為肝門部膽管癌、膽管中段腫瘤，以及膽管末端腫瘤。如果膽管里有結石，內科ERCP(經內鏡逆行性胰膽管造影)取不出來，需要做手術，也是由肝膽外科醫生處理。胰頭、十二指腸腫瘤，有時候肝膽外科醫生也可以處理；4、其它：肝臟疾病誘發的脾功能亢進、脾大、上消化道出血，有些醫院肝移植也在肝膽外科進行。如果各種綜合性肝病需要做肝移植，也是由肝膽外科處理，有的醫院可能肝移植科是獨立科室。