導致肝內外膽管擴張的原因，主要是膽道梗阻，尤其是膽管下段梗阻。無論是結石、炎性狹窄或腫瘤引起的膽管下段梗阻，均會出現膽道內壓力升高，膽汁排出不暢，從而出現肝內、肝外膽管擴張。肝內膽管是指肝臟實質內的膽管，而肝外膽管包括肝總管、膽總管以及膽囊。若梗阻部位在膽囊管開口以下，會出現膽囊增大，若梗阻部位在膽囊管開口以上，膽囊不會增大。若合并有疼痛的膽管擴張，通常首先考慮是結石，尤其是掉入膽管下段的結石會引起疼痛、膽管擴張、黃疸、發熱等。若為無痛的皮膚、眼睛發黃進行性加重，檢查發現肝內、肝外膽管擴張，老年人首先考慮膽管惡性腫瘤，或膽管周圍某些腫瘤性疾病，壓迫膽管所致。