多數情況下做胃腸鏡不需要住院，在門診便可完成。即使做無痛胃腸鏡檢查，多數也可以在門診完成。當天在門診做完無痛胃腸鏡后便可以回家，但注意不能開車，因為打麻藥與飲酒作用相似，對人體反應能力有一定影響。但做胃腸鏡的同時需要治療息肉，可能需要提前安排住院。不同地區、醫院、科室習慣不同，患者需要與準備就診的醫院或門診溝通，詢問是否需要住院。如果是普通胃腸鏡檢查，一般不建議同時進行，以免導致患者難以耐受。如果是無痛胃腸鏡，因為對于患者而言可以減少一次麻醉，因此一般醫院會選擇同時進行。