引起早上刷牙出血的病因很多很復雜，主要如下：1、口腔因素：有可能由于其局部的口腔因素引起，例如牙齦炎、牙周炎最容易引起早上刷牙出血。另外患有牙髓炎、根尖周炎以及齲病的患者，特別是伴有牙齦增生、牙齦息肉、牙髓息肉的患者，早上刷牙后會出現相應的出血；2、全身系統性疾病：對于有全身系統性疾病的患者，例如血液病以及咽喉、鼻咽炎的患者，對于有胃腸道疾病的患者，包括胃潰瘍等，均有可能會出現早上刷牙出血的問題。具體原因建議患者應盡早到正規醫院的相關科室進行檢查，建議首選口腔科。從口腔科開始進行相應排查，將口內疾病以及牙齒、牙齦問題得以相應的針對性治療，針對病因給予相應的全口潔治、根管治療以及口腔護理等。如果此問題仍未得到明顯的解決，可以繼續往下追查，到底是否為鼻咽炎以及全身的問題，針對其相應的病因給予相應治療。