結石形成的原因目前尚不完全明確，但形成結石最核心的理論就是形成結石的各種鹽類，包括草酸鹽、尿酸鹽，在尿中濃度過高，形成結晶，最后長成結石。草酸鹽和尿酸鹽是由于人體攝入各種食物，特別是含嘌呤類較高的食物，如動物內臟、海鮮、某些動物肉類等，就會容易造成人體內含有許多嘌呤，嘌呤在體內代謝，就會產生各種尿酸和草酸。還有部分草酸的來源途徑是含草酸量高的綠葉蔬菜，在人體代謝后，形成草酸鹽和尿酸鹽。當機體出現各種狀況，尿液濃縮，以上鹽類再加上形成結石的機制，比如經常形成結石時，會存在感染，細胞脫落，細胞的尸體連同細菌一起形成結石結晶的核心，結石就圍繞著這些核心生長。最早的部位可能是在腎盂、腎盞，結石可能會脫落至輸尿管。也有些老年人出現營養不良時，直接在膀胱內形成結石。此為結石形成的基本病因，根據這一基本病因，預防結石有2個重要的要素。第一，多飲水，降低成石基質的濃度；第二，盡量少進食含草酸和尿酸的食物，盡量限制，特別注意需要適度補鈣，少進食嘌呤類高的食物。