兩側腎區出現隱隱作痛的原因，需要區分腎區不同的組織和器官的病變，例如皮膚、腰肌、腰椎以及腎臟或者輸尿管，分析如下：1、如果是皮膚出現病變，最常見的就是外傷、蚊蟲叮咬或者帶狀皰疹等可以引起隱隱作痛，而且帶狀皰疹引起的疼痛是非常嚴重的，很多人無法忍受，持續時間比較長，從外觀上可以進行鑒別診斷；2、腰肌出現外傷、炎癥以及腰肌勞損可以出現疼痛，特別是腰肌勞損發病率比較高，在活動后可以加重或者減輕；3、腰椎的異常包括椎間盤突出和骨質增生等，也包括外傷，根據外傷的病史以及腰椎的X光片，或者腰椎CT，進行詳細的鑒別診斷，在彎腰或者提重物的時候可能加重，提示是椎間盤突出；4、如果排除皮膚、腰肌以及腰椎的問題，可能是腎臟出現異常，造成腎臟的疼痛的病變常常是炎癥、結石、積水、出血或者腫瘤變位，需要進一步做影像學來進行鑒別診斷。如果進行結石和感染，治療可以使這種疼痛消失，而腫瘤和結石以及出血或者積水，必須泌尿外科來進行積極的治療，才能使疼痛得到很好的治療。