腎結石的碎石不會導致腎衰竭。體外沖擊波碎石屬于有創的治療，要求同一個部位，不能夠連續碎石3次。以腎結石為例，沖擊波能量特點是遇硬則強，即能量傳遞過來，對硬的石頭損傷、粉末化的能量會最強，但石頭周圍被腎臟所包繞，對腎臟只是損傷小而已，但并非對腎臟沒有損傷。如腎臟本身不健康，如患有慢性的腎病、腎炎等狀況，體外沖擊波碎石甚至可能導致腎臟的破裂，但非常少見，可不用再擔心。主要可能會造成血腫，包括在碎石后由于感染性結石會粉末碎開，內部細菌也會顯露出來，導致極少部分的患者在碎石后出現感染、發熱等狀況。