臨床常用抗厭氧菌的藥物，主要包括以下幾類：1、硝基咪唑類：包括甲硝唑、替硝唑、奧硝唑，藥物抗菌譜較廣，臨床應用較廣泛，對于抗厭氧菌的治療效果較好；2、青霉素類：青霉素可以治療氣性壞疽，由產氣莢膜梭狀芽孢桿菌感染引起。其他青霉素類，比如氨芐西林舒巴坦、哌拉西林他唑巴坦、替卡西林克拉維酸，包括脆弱類桿菌在內的厭氧菌感染，有一定抗厭氧作用，通常也會用于呼吸道、腹腔或者盆腔的厭氧菌感染；3、克林霉素：克林霉素對于不含有芽孢，以及非梭菌屬的厭氧菌，有一定的抗厭氧作用，所以長時間應用克林霉素，可以引起腸道菌群紊亂，導致厭氧菌被消滅，其他細菌過度生長，引起二重感染；4、頭霉素或者拉氧頭孢類：比如頭孢西丁，拉氧頭孢也有一定抗厭氧作用；5、碳青霉烯類：比如亞胺培南。