深呼吸時咳嗽通常是由于吸入外界空氣造成對氣道的刺激，從而引起咳嗽，這種咳嗽通常與氣道高反應相關。引起氣道高反應的疾病通常是氣道有炎癥，一般是以嗜酸粒細胞浸潤為主的炎癥，很有可能是與過敏相關的疾病，與過敏相關的疾病最常見的是咳嗽變異性哮喘。咳嗽變異性哮喘是一種特殊類型的哮喘，咳嗽特點就是陣發性干咳，可以被外界因素所誘發，如吸入冷空氣、花粉、灰塵等，而且在夜間和凌晨發作明顯。除了咳嗽變異性哮喘，嗜酸粒細胞性支氣管炎、變異性咳嗽，都可以出現由外界環境變化而帶來的咳嗽，由外界刺激因素誘發咳嗽。到底是哪一個疾病還需要做相關檢查才能進一步確診，咳嗽變異性哮喘需要做氣道激發試驗來確診，而嗜酸粒細胞性支氣管炎需要做痰的細胞計數和分類進行確診。