睡覺醒來肩膀疼痛的原因，常見有以下幾種：1、睡覺姿勢錯誤：例如側著睡，由于姿勢不好，一側牽拉肩膀，比如往左側睡時，牽拉右側肩膀，長時間可能會產生右側肩膀的疼痛，特別是側睡時枕頭較低，更加容易產生對側肩膀肌肉的過度牽拉，產生疼痛感；2、受冷：受冷后，由于冷刺激導致頸椎的椎間盤突出癥狀加重，也可能會產生頸肩部的疼痛現象；3、落枕：睡落枕后患者，不但會出現頸部肌肉的疼痛，嚴重時還會連帶出現肩膀疼痛的現象；4、肩袖損傷：肩袖損傷患者睡覺時姿勢不注意，牽拉肩袖，通常可能會導致肩膀的疼痛現象出現。