如果不采取醫療措施，腎囊腫不會自行縮小，除非發生破裂，因為不管是良性的腎囊腫，還是惡性的腎囊腫，都是腎臟病變的一部分，特別是良性的腎囊腫，是腎臟老化的表現，隨著年齡的增長會逐步增大。如果確認是良性的，在直徑＜5cm時動態觀察即可，當直徑＞5cm時需要穿刺、抽液，使腎囊腫縮小。如果是惡性的，不論大小，不管病人的年齡、性別以及種族，都需要積極做腎臟強化CT或者腎臟囊腫的磁共振，來確認是否確實存在惡性病變，存在惡性病變的囊腫需要泌尿外科積極行手術處理。如果是多發性的囊腫，特別是多囊腎，也不可能使囊腫自發性地縮小，除非發生破裂，囊腫的內容物流出使囊腫縮小，但是這是一種病態，可以造成病人嚴重的疼痛、感染或者體溫升高。多囊腎病人一般不處理多發性囊腫，因為處理了大的囊腫以后，小的囊腫會更加快速地長大，造成更加嚴重的后果。