小兒發燒時如果不能口服用藥，可以通過灌腸進行治療，正規的灌腸操作不會對患兒身體造成明顯影響。但是反復操作或者經常性的處理，可能影響患兒的腸道菌群狀態和微生態狀態，影響肛周肌肉狀態，導致便秘、腹瀉、大便失禁等情況。所以灌腸通常不作為首選的退熱方法，另外由于患兒年齡較小，不能完全配合灌腸動作，可能對肛門造成損傷。但是患兒發熱時，如果對藥物出現明顯的嘔吐反應，無法進行口服用藥，可以緊急使用灌腸治療，給藥后降低體溫，緩解病情。