如果是偶爾一次小兒灌腸，不至于身體造成特別大的影響。因為小兒灌腸主要是將藥物通過肛門、直腸周圍的靜脈給藥，藥物可以通過直腸靜脈直接吸收入血，不再經過小兒的消化道和肝臟代謝，對胃腸道和肝臟的損傷要小些。但是如果總是反復頻繁地灌腸，可能會對小兒身體造成一定程度的影響。如果灌腸的時候，手法不能夠特別輕柔，可能會損傷小兒腸道的局部黏膜，引起黏膜出現充血、水腫，嚴重則可能導致黏膜出血。還有一部分家長在進行灌腸的時候，未能夠及時進行無菌操作，可能導致細菌植入腸道內，引起外源性細菌感染，出現腸炎的癥狀。除此以外，灌腸也會導致小兒腸道菌群受到一定的破壞，干擾自身的腸道菌群，導致腸道菌群的屏障功能受到一定程度的影響，引起胃腸功能紊亂，出現腹脹、腹痛、腹瀉的癥狀，或者是腹瀉和便秘交替出現。所以小兒灌腸偶爾使用一次，不會對身體造成特別大的影響。但是如果頻繁使用，對小兒身體還是有一定程度的害處。要嚴格掌握小兒灌腸的適應證，不要頻繁使用。