高密度脂蛋白膽固醇偏低，意味著高密度脂蛋白膽固醇對于血管的動脈粥樣硬化的保護作用會下降。因為高密度脂蛋白和高密度脂蛋白膽固醇是一種保護血管不發生動脈硬化，或者少發生動脈硬化的血脂成分，是一個好的血脂成分，對心臟血管和腦血管都有保護作用。高密度脂蛋白偏低或者高密度脂蛋白膽固醇偏低，常見于老年人，年齡大了肝臟合成高密度脂蛋白膽固醇的能力就偏低，所以高密度脂蛋白會下降。有些患者降得比較低，可以給予藥物治療，目前治療高密度脂蛋白膽固醇低的藥物還是傳統的那幾類，包括煙酸類藥物、貝特類藥物和他汀類藥物。這三類藥物是通常調整低密度脂蛋白膽固醇高，還有甘油三酯高常用的藥物。這些藥物在治療高甘油三酯血癥和高膽固醇血癥的同時，也能升高高密度脂蛋白膽固醇，大概升高10%。因此這些藥物的抗動脈粥樣硬化中的實現，一部分來自于它升高高密度脂蛋白膽固醇。