根尖手術麻醉方式選擇，首先要考慮病變范圍大小。如果病變范圍較小，可以在門診局麻下完成，如果囊腫范圍波及較大，需要進入手術室在麻醉下完成。具體選擇局麻或全麻，除病變大小以外，還要考慮患者主觀要求。局麻可以完成手術，但有些患者由于自身對于疼痛敏感，且精神緊張，會主動要求在全麻下完成手術。現在隨著全麻技術的不斷進步，越來越安全，藥物在麻醉后反應比較小，所以全麻比較安全。而且全麻優勢是整個操作過程中無需患者主動配合，術中如果出血，因為有麻醉插管保護，不易導致誤吸等并發癥。所以根尖囊腫采用局麻還是全麻與病變大小、患者要求，還有整個治療復雜程度有關。