根尖肉芽腫不存在真正的上皮形成囊性病變，局部病變主要包括炎性細胞局部浸潤，纖維細胞、成纖維細胞、血管成分等。此類型病變可自行吸收消退，一旦形成根尖囊腫，出現真正的上皮組織增生，即使是良性病變，無法自行吸收或者消退。因此，一旦確診根尖囊腫，必須通過外科手術完整刮除病灶，將病源牙齒徹底治療好，才可能得到根治，否則不可能自行消退。