穿支動脈病變的損害特點，與主干病變以及皮層支病變不同。通常穿支病變的臨床癥狀較輕微，患者可能有輕偏癱、輕度感覺障礙、輕癥的偏盲，還有部分患者有較輕的共濟失調、走路不穩、飲水發嗆以及輕度嗜睡。穿支病變通常破壞的結構相對范圍不大，為小血管病，梗死面積較小，癥狀較輕。而大動脈閉塞、主干病變、皮層支損害的癥狀相對較重，除癱瘓外，還伴有凝視，眼睛往一邊看，偏癱、失語或者很嚴重的癱瘓。當然，也不是所有的穿支病變都特別輕，有一種特殊類型叫做關鍵部位梗死。如果穿支病變在內囊后肢發生，即管理肢體運動的皮質脊髓束的走行處出現病變，則癱瘓較重。