磁共振圖像信號的采集，主要是利用高強度的磁場，而不是電離輻射，所以對人體沒有輻射損傷，而且磁共振成像的軟組織分辨率比較高，沒有骨偽影的干擾，特別適合于顱腦、脊髓、腹盆腔實質臟器、乳腺、關節及軟組織病變的檢查，比如顱腦、腦垂體區，就可以用來觀察腦血管的疾病，腦外傷、炎性脫髓鞘疾病、腦炎、腦寄生蟲感染以及腫瘤等。 在垂體病變中，可以觀察有沒有尿崩癥、垂體瘤。在面神經、聽神經、三叉神經病變也可以觀察到，而且還可以做腦血管MRA，頸部血管MRA來觀察腦血管有沒有畸形、血管瘤、動脈硬化等。還有腦波譜成像、灌注成像、彌散加權成像、磁敏感成像等多功能成像。顱內腫瘤的定位、定性診斷，異常腦功能病變的范圍，以及腦出血等的檢出。 對于脊柱、椎體及椎間盤的病變，脊髓病變如腫瘤、炎癥、外傷，都有較好優勢。而對于胸部、腹部、縱膈的疾病、炎性病變、腫瘤病變，如乳腺腫瘤、縱隔腫瘤、肝膽胰脾腎臟的腫瘤等，也是有比較高的檢出率。膽道有MRC、泌尿系統有MRU，可以觀察有沒有結石、腫瘤、炎癥等。對于盆腔的病變可以對腫瘤進行分期，盆腔的炎性病變、腫瘤病變，也可以有很高的檢出率，比如前列腺增生、前列腺腫瘤、膀胱腫瘤、婦科腫瘤、直腸腫瘤等。 對于四肢關節，可以觀察骨質、肌肉、肌腱的損傷，還可以觀察腫瘤性病變、炎性病變，還可以觀察心臟及大血管的成像，可以看心肌病，而且還可以觀察有沒有動脈夾層、動脈瘤等，所以磁共振檢查可以用于身體多部位的檢查，而且診斷率比較高，診斷的敏感性也較高。